В современной Сонной лощине оказывается десятилетний мальчик, имя которого неизвестно (Джон Доу). Проблема в том, что он одет в одежду 16 века и говорит на средневековом английском. Эбби Миллс и Икабод Крейн идут по следу мальчика и находят Потерянную Колонию, ту самую, связанную с легендой о «Кроатоне». Тем временем власти Сонной Лощины борются с опасной эпидемией, которую мальчик принес с собой, ведь на Роанок (Потерянную Колонию) напал всадник по имени Чума, цель которого выбраться в реальный мир.